The
був розроблений у 1849 році Нарсісо Лопесом, прихильником незалежності, який жив у Нью-Йорку. Дизайн прапора Пуерто-Ріко був прийнятий комітетом вигнанців, які жили в Нью-Йорку в середині 1890-х років.
Дизайн прапора заснований на прапорі Куби з інвертованими червоним і синім кольорами. Відтінок синього для трикутника залежить від того, кого запитують. Можна побачити прапори з темно-синім кольором, наприклад, на зображеному прапорі, небесно-блакитний ("azul celeste") або королівсько-блакитний трикутник. «Офіційного» відтінку синього не існує.
У квітні 1869 р. Прапор Лопеса був визначений національним прапором Конгресом Республіки Куба. Прапор Лопеса був зразком для прапора Пуерто-Ріко, прийнятого в 1895 році Революційним комітетом Пуерто-Ріко, групою, що виступала за незалежність, яка працювала під егідою Кубинської революційної партії.
Прапор № 4: Куба, хоча він і тих самих кольорів, це явно не була повна копія прапора США. Білі смуги символізують чистоту ідеалів. А блакитні смуги символізують три департаменти Куби. Єдина біла зірка означає, що Куба є незалежною державою.
Революційний прапор Ларес (перший прапор Пуерто-Ріко) був пов'язаний у 1868 році лідером незалежності Маріаною Брачетті. Він вилетів того ж року під час El Grito de Lares, першого великого повстання проти іспанського колоніального панування.
Запроваджено, щоб здивувати рух за незалежність на острові, La Ley de la Mordaza заборонила демонстрацію чи володіння прапором Пуерто-Ріко; навіть у власному домі.