У постімплантаційному ембріоні миші спостерігається експресія Pou5f1 знижена регуляція при диференціації епібластів і його експресія підтримується лише в примордіальних статевих клітинах (51).
Активність фактора транскрипції часто регулюється (de) фосфорилювання, що може впливати на різні функції, напр. ядерна локалізація зв'язування ДНК і транс-активація. Зв'язування ліганду є іншим способом активації фактора транскрипції. Це характерно для великої надсімейства рецепторів ядерних гормонів.
Зокрема, експресія генів контролюється на двох рівнях. По-перше, транскрипція контролюється обмеженням кількості мРНК, яка виробляється з певного гена. Другий рівень контролю здійснюється через посттранскрипційні події, які регулюють трансляцію мРНК у білки.
Експресія генів регулюється транскрипційні та посттранскрипційні шляхи, які мають вирішальне значення для оптимізації виходу генів і для координації клітинних програм. МікроРНК (міРНК) регулюють мережі експресії генів, необхідні для правильного розвитку, життєздатності клітин і реакції на стрес.
Регуляція експресії генів є складним процесом, який вимагає скоординованої діяльності різних білків і нуклеїнових кислот, які в кінцевому підсумку визначають, чи транскрибується ген, і, якщо транскрибується, чи призводить це до виробництва білка, який розвиває фенотип.
Як і в бактерій, в еукаріотичних клітинах відбувається транскрипція контролюється білками, які зв’язуються зі специфічними регуляторними послідовностями та модулюють активність РНК-полімерази.