У 6 сезоні Сем проводить час без душі. Після того, як він відновлює її, він дізнається про період, але він вважає за краще не знати, що сталося, і продовжує своє мисливське життя, ніби нічого не сталося.. У всіх розділах він пам’ятає деталі, але навіть у цьому випадку він, здається, спокійно нічого не знає.
Сем розслідує справу про зниклих немовлят, батьків яких убивають. На одному з місць злочину він виявляє залишену дитину і кличе Діна на допомогу. Не бажаючи залишати Лізу та Бена, Дін нарешті погоджується зустрітися з Семом, щоб він побачив, яким Дін став батьком.
Сем Вінчестер теж деякий час провів у клітці, але був «врятований» Смертю. Він не зміг виховати Сема своєю душею, тому він провів понад рік (понад 120 років у пеклі) у клітці під тортурами Люцифера, аж до смерті, нарешті одужавши.
«Плутанина» між «братами Вінчестерами» сталася чому, невдовзі після оголошення про те, що CW виробляє нове «Надприродне» спін-оф шоу, з Дженсен залучений, Джаред привітав його в Twitter, давши зрозуміти, що немає Я знав про нову справу. — Джаред Падалецький (@jarpad) 25 червня 2021 р.
Отримав кров Азазеля і придбав надздібності Сем був одним із дітей, яких демон Азазель заразив своєю кров'ю ще немовлятами. Завдяки цьому Вінчестер отримав деякі здібності, які дозволяли йому робити такі речі, як опір демонічному контролю, ясновидіння і навіть знищувати демонів простою думкою.