Сильні магнітні поля, присутні в плямах, перешкоджають локальному потоку тепла з нижніх шарів, тому вони приблизно на 1500 °K холодніші (Smoluchowski, 1986) і, отже, темніші за решту видимої поверхні.
Чому сонячні плями відносно холодні? Це тому що Вони утворюються в областях, де магнітні поля особливо сильні . Ці магнітні поля настільки сильні, що не дозволяють частині тепла Сонця досягти поверхні.
в принципі, сонячні плями не впливають на клімат Землі. Вони не відображають падіння температури на Землі, оскільки немає помітної різниці між світлом, випромінюваним Сонцем, коли є плями та коли їх немає. Насправді сонячні плями ніяк не впливають на Землю.
Сонячні плями стають темними тому що вони холодніші, ніж їх оточення . Великі сонячні плями на тисячі градусів холодніші, ніж області навколо них (приблизно 4200 °C для сонячної плями, порівняно з 6000 °C для навколишньої фотосфери). Сонячні плями лише темні на відміну від світлої сторони Сонця.
Для Галілея, всупереч тому, що пропонували Шейнер або Апеллес, Плями знаходяться або на поверхні Сонця, або дуже близько до нього, як було сказано, вони не є іншими зірками або твердими тілами, оскільки вони постійно розчиняються та утворюються..
Завдяки сильному магнітному полю магнітний тиск зростає, а навколишній атмосферний тиск знижується . Це, у свою чергу, знижує температуру відносно навколишнього середовища, оскільки концентроване магнітне поле перешкоджає потоку гарячого нового газу з внутрішніх частин Сонця на поверхню.