Лідер Mothers of Invention також виявив глибоку любов до The Beatles, Ніл Янг, Black Sabbath і деякі з ранніх великих блюзів, зокрема Мадді Вотерс і Хоулін Вулф.
Насправді Заппа проводив такий сильне несхвалення групи, що під час свого туру 1988 року він і його група виконали повністю сатиричне виконання пісні «Stairway to Heaven» у стилі реггі.
«Усі інші вважали себе Богом!» Заппа сказав про The Beatles. «Я вважаю, що це було неправильно. Вони були просто хорошою комерційною групою.” Збочений до останнього, він дав зрозуміти, що віддає перевагу The Monkees.
У підлітковому віці він набув смаку до класичних композиторів 20-го століття, таких як Едгард Варез, Ігор Стравінський та Антон Веберн, а також ритм-н-блюз 1950-х років.
Його творчість характеризується нонконформізмом, експериментуванням зі звуком імпровізації, музичною віртуозністю та сатирою американської культури. Заппа також був режисером повнометражних фільмів і музичних відео, а також створював обкладинки альбомів. Його вважають одним із найбільш новаторських і стилістично різноманітних музикантів свого покоління.
Я віддав перевагу The Monkees”. У розмові з Джеррі Гопкінсом із Rolling Stone у 1968 році Заппу запитали, чи серйозно він говорив, коли він сказав фронтмену Monkees Деві Джонсу, що йому подобається його музика більше за все, що він чув із найяскравішого творчого центру епохи та батьківщини контркультури, Сан. Франциско.